미생물의 분류

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미생물의 분류에 대한 보고서 자료입니다.

목차

목 차


1. 미생물의 분류에 대한 일반적 소개와 개요

2. 미생물이란?

3. 미생물 분류의 기본단위 ‘종’

4 미생물의 분류학적 위치

5. 미생물의 분류 조건

6. 분류군의 계급

7. 미생물의 분류법

8. 미생물의 명명법

9. 미생물의 동정

10. 참고 문헌

본문내용

. 미생물의 동정
동정(Identification)의 작업은 어떤 생물개체를 학명이 붙어 있는 표본과 비교하는 가장 단순한 생물학적 수단으로부터 정해진 방법에 따라서 실험하여 얻은 많은 수의 데이터를 모아서 정리하여 신뢰할 수 있는 분류체계(System of Classification)의 정해져 있는 분류기준(Criteria)과 대조하여 서로 같고 다른 점을 밝히고 종합적인 판단을 하는 복잡한 수단에 이르기까지 여러 가지 수단에 의해서 분류체계상에서 그 생물체계의 어디에 속하는 것인가를 결정하는 것이 목적이다. 동정은 분류체계의 기초가 되는 체계이론의 연구와는 관계가 없는 일이며 분류에 있어서 체계를 세우기 위해서는 동정보다 훨씬 많은 생물개체와 성질을 취급하게 된다. 요컨대 동정이라 함은 대상이 되는 생물개체에 대한 성질의 조사결과로부터 기준으로 하는 분류체계에 따른 그 생물의 분류상의 위치를 결정하게 되는 과정이며 필요한 분류체계와 방법만 정해져 있으면 분류학의 전문가가 아니더라도 용이하게 할 수 있는 작업이다.
동정의 작업은 일단 명명규약에 따른 학명을 선정하는 데 그친다. 학명의 선정은 종명(또는 아종명, 변종명)까지 하는 것이 바람직하지만 때로는 종까지 확인하지 못하고 속에서 끝나는 경우도 있다. 이러한 경우에는 속명 다음에 species의 약여인 sp.를 붙여서 표기한다.
『最新食品微生物學』탐구당, 2000년 2월 25일, 하덕모 역 p.43 참고
미생물의 종류별 동정법
① 세균의 동정
여기서 세균은 Bacteria와 Archaea를 포함한 prokaryotic microorganism을 의미한다. 최근의 세균의 동정은 16S rRNA 유전자 분석에 크게 의존하고 있다. 현재까지 알려진 세균의 종은 약 4200 개로, 이들 중 상당수 종의 표준 균주에 대하여 16S rRNA 유전자의 염기서열이 분석되어 있다. 결과적으로 동정하고자 하는 균주의 16S rRNA 유전자를 분석하면, 이 균주가 전체 세균 중에서 어느 종에 가까운지를 알 수 있게 되었다. 현재 국제적인 합의 (학문적)에 의해 2차 구조를 이용한 정확한 염기서열 정열 후에 유사도가 97% 이내이면 다른 종으로 본다. 하지만, 97% 이상이라고 하여 꼭 같은 종인 것은 아니므로, 이때는 다른 분류학적 정보를 이용해야 한다. 이외에 자동화된 동정 시스템으로 MIDI (지방산분석), BIOLOG, API 등이 있다. 이들은 일부 그룹의 세균의 동정에 적합하나, 16S rRNA 분석처럼 세균 전체를 범위로 두는 것은 아니다. 또한, 최근에 발표된 종은 이들 데이터베이스에 들어있지 않다.
② 효모의 동정
효모의 경우 전통적으로 탄소 및 질소의 이용성을 조사해서 동정하는 방법이 많이 사용되어 왔다. 그러나 최근 대부분의 표준균주에 대해서 26S rDNA D1/D2 부
<그림-1> 미생물의 분리와 동정
분의 염기서열이 결정되었고 이를 이용해서 효모를 동정할 경우 가장 정확한 결과를 얻을 수 있다. 교배 가능성과 염기서열 차이를 분석한 결과 약 600 bp에 달하는 26S rDNA D1/D2 부분의 염기서열이 1% 이상 차이가 날 때 다른 종으로 인정되고 있다. 1% 이내의 염기서열 차이를 보일 경우 반드시 같은 종이라고 볼 수는 없지만 반대되는 증거가 없는 경우 같은 종으로 인정하고 있다.
③ 곰팡이의 동정
현재 가장 동정하기가 어려운 미생물이 곰팡이다. 거의 대부분의 경우 형태학적인 관찰을 기본적으로 해야 한다. 염기서열 Database가 어느 정도 축적되어 있는 Trichoderma나 Colletotrichum 같은 일부 분류군의 경우 ITS부분의 염기서열(600-800 bp)로 종 level까지 동정이 가능하나, 이러한 경우에도 형태관찰을 보조적으로 해야 한다. 곰팡이의 경우 분류군에 따라 종 내 유사도가 다양하게 나타나 종 동정을 위한 절대적인 염기서열 유사도의 기준치는 존재하지 않는다. 속 level은 대부분의 경우 26S rDNA의 D1/D2 부분의 염기서열 결정으로 동정이 가능하다.
<표-3> 미생물의 동정 기준
『http://plaza4.snut.ac.kr/ - 서울산업대 식품공학과』참고
형태학적 특징
현미경 : 모양, 크기, 배열, 포자 형성의 유무와 모양, 그램 염색성
육 안 : 배양 성상(고체배지에서의 colony)
생리학적 특징
에너지 발생 양식, 발육 온도, 산소 요구도
생화학적 특징
당류의 분해와 발효, indole생성, H2S생성, 질산염 환원, oxidase의 작용, 녹말의 가수분해, gelatin의 가수분해, 혼합 산 생성(methyl red시험), acetylmethyl carbinol생성(Voges-Prokauer 시험), 세포벽 성분, 효소 단백질 생성
생태학적 특징
생식 장소, 기생성, 병원성
혈청학적 특성
세포 표층 물질 및 부속 기관(세포벽, 협막, 편모)의 입체 화학적 특징을 혈청 반응에 따라 항원이라는 parameter로 나타내는 것이다.
분자 유전학적 특징
미생물 유전자의 nucleotide배열에 기초를 둔 것이다. 그러나 물리화학적으로 nucleotide배열의 전모를 알기에는 불가능하므로, 분자생물학적 해석법으로는 DNA의 평균 조성, DNA의 염기 배열 상동성 또는 유전 물질의 전달 효율의 비교로서 계통 분류, 해석된다.
10. 참고 문헌
『NAVER 지식검색 - Encyber 두산세계대백과』
『微生物學』 아카데미서적, 2003년 2월 10일 발행, Roger Y. Stanier 외역
『식품미생물학』 삼광출판사, 2000년 1월 10일 발행, 류근태 외역
『미생물학 제 5판』 라이프 사이언스, 2003년 1월 발행, 김경민 외역
『http://home.postech.ac.kr』
『最新食品微生物學』탐구당, 2000년 2월 25일, 하덕모 역
『대학미생물학』탐구당, 1999년 2월 25일, 민경희 외역
목 차
1. 미생물의 분류에 대한 일반적 소개와 개요
2. 미생물이란?
3. 미생물 분류의 기본단위 '종'
4 미생물의 분류학적 위치
5. 미생물의 분류 조건
6. 분류군의 계급
7. 미생물의 분류법
8. 미생물의 명명법
9. 미생물의 동정
10. 참고 문헌

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