미생물 균 동정 및 분리

소개글

미생물 균 동정 및 분리에 대한 보고서 자료입니다.

목차

◆미생물 자동화기기 및 각종 동정 KIT◆

◆유전자를 이용하는 검사법◆

본문내용

게 되므로 사용할 제한효소 선택이 해석 결과를 좌우한다.
d. Pulsed-field gel electrophoresis (PEGE)
PEGE는 거대한 DNA사슬을 영동하는 방법으로 개발되었다. 일반적으로 20kb를 넘는 크기의 DNA 단편을 전기영동으로는 분리다 아주 어렵다. 또한 긴 DNA 사슬을 처리도중이나 영동중에 물리적으로 잘라 버린다. PEGE에서는 용균, DNA 유출 ,제한효소에 의한 절단등의 반응을 모두 한전 블록 속에 봉입한 상태로 한다. 그리고 전기영동은 전하의 방향을 변화시킨다. 이 조작에 따라서 DNA 사슬이 한천 겔의 틈을 빠져 나오도록 영동된다. PEGE도 모두 균종의 형별이 가능하고 분리, 형불리 능력이 우수하다. 그리고 PEGE는 다른 해석방법에 비해서 사용하는 시약량이 많고 측정 대상별로 반응조건을 설정할 필요가 있는 등의 단점이 있다.
e. PCR 증폭산물의 제한효소 처리분석 (PCR restirction digest)
이 방법은 앞서의 제한효소처리에 의한 다형성 분석의 응용이다. 즉 PCR에 의해 특정 영역의 DNA를 증폭한 후 이것을 제한효소로 절단, 증폭산물 단편의 다형성을 해성한다. 본법은 현재 널리 사용되고 있는 방법으로 신속성이 뛰어나고 재현성도 양호하다. 분리, 형별능을 증폭부위나 사용하는 제한효소에 따라 영향을 받는데 미리 표적이 되는 부분만을 비교할 수 있고, 해석을 특별히 필요로 하지 않는 점이 장점이다.
f. Arbitrary primer 을 사용한 PCR법 (AP-PCR)
AP-PCR법은 특정부위를 증폭하는 일번적인 PCR과는 다르다. 대상 부위의 염기배열과 관계없는 primer를 사용하고 저온에서 annealing을 하는 증폭법이다. 그 결과 염색체가 다양한 장소에서 크기가 다른 움단편이 증폭된다. 이것을 전기영동해서 얻은 패턴은 균주간에 비교한다. 즉 게놈에 차실이 존재하면 그 영역에 유래한 밴드기 확인되지 않고 역으로 게놈의 중복이 밴드의 증강으로서 관찰된다. AP-PCR은 annealing 온도가 낮기 때문에 그 재현성이 낮을 단점이 있다. 그리고 해석성능도 PFGE 에 비하면 아직 낮다.
g. Nucleotide sequence analysis
이것은 염색체 DNA 혹은 rRNA의 염기서열을 직접 비교하는 방법이다. 일반적으로 클로닝 혹은 PCR 등에 따라서 증폭한 일부분을 비교해소 사용한다. 이 방법은 세균 분류학에서 자주 이용되는 방법이다.

키워드

병원균,   동정,   미생물 분리,   KIT,   미생물