목차
1.Introduction
2.Methods
3.result
4.Discussion
5 .Reference
2.Methods
3.result
4.Discussion
5 .Reference
본문내용
행하면 결과가 끊어진 몇 개의 조각들로 출력이 되는데, BLAST 2.0에서는 gap을 도입하여 FASTA 와 같이 insertion 과 deletion을 도입하여 상동성이 있는 조각들을 연결하여 결과를 보여준다.
PSI-BLAST : NCBI에서는 PSI(Position-Specific Iterated)-BLAST를 최근 개발하여 서비스 하고 있다. PSI-BLAST는 일반 BLAST의 기능에 motif이나 profile의 비교 기능을 추가한 프로그램이다. 즉 PSI-BLAST는 기본적인 BLAST검색을 수행한 후 그 결과를 이용하여 multiple alignment를 수행한다. Multiple alignment 를 통해 position-specific score matrix를 제작하고 이 matrix를 이용하여 다시 BLAST 검색을 수행한다. 즉 일반 검색과 motif, profile 검색을 동시에 수행하게 되는 것이다. 진화적으로 멀리 떨어져 있는 homolog 서열을 찾는데 유리하게 사용될 수 있다
5 .Reference
*http://www.horti4u.com/zboard
/
*www.empas.com
*www.biosci.snu.ac.kr
PSI-BLAST : NCBI에서는 PSI(Position-Specific Iterated)-BLAST를 최근 개발하여 서비스 하고 있다. PSI-BLAST는 일반 BLAST의 기능에 motif이나 profile의 비교 기능을 추가한 프로그램이다. 즉 PSI-BLAST는 기본적인 BLAST검색을 수행한 후 그 결과를 이용하여 multiple alignment를 수행한다. Multiple alignment 를 통해 position-specific score matrix를 제작하고 이 matrix를 이용하여 다시 BLAST 검색을 수행한다. 즉 일반 검색과 motif, profile 검색을 동시에 수행하게 되는 것이다. 진화적으로 멀리 떨어져 있는 homolog 서열을 찾는데 유리하게 사용될 수 있다
5 .Reference
*http://www.horti4u.com/zboard
/
*www.empas.com
*www.biosci.snu.ac.kr
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