[생화학 실험] 프로테오믹스 (Proteomics)

목차

1. 프로테오믹스의 개요

2. Proteomics의 필요성
① 단백질의 중요성
② Genome 정보의 구체화
③ 유전자의 한계

3. 프로테오믹스의 응용

4. Proteomics의 목적 및 중요성

5. 프로테옴 분리 및 동정
ㄱ. 단백질체 연구의 기본 3단계
ㄴ. 단백질 분리 : 2D-electrophoresis
1) IEF (isoelectric focusing)
2) Sample준비 과정
3) 분석과정
4) 2D 분석의 장단점

◎ NCBI (National Center for Biotechnology Information)
◎ DNA chip(MicroArray)
◎ SNP (Single Nucleotide Polymorphism)

본문내용

말 그대로 생물 정보의 요충지이다.
2003년 5월 시점에 350명 규모, 사무 13명이었으며 장래 목표는 전체 500명
Computational Biology Branch (CBB) 일종의 리서치 부대 (90명)
- 유전자발현, 통계와 alignment, 단백질 구조, 진화, 비교유전체, 통계수학, 언어처리, 생물학, 단백질분류학 등의 팀으로 나눠져 팀 당 평균 8명이지만 실제로는 1~30명 이상으로 팀마다 상당히 다름. 눈에 띄지는 않지만 실제 연구 조직은 여기라고 할 수 있다.
Information Engineering Branch (IEB) 웹 작성 부대 (201명)
- 반수는 회사파견 형태 (contractor), H1 guys (러시아, 중국, 인도 등에서 온 연구자들이 많으며, H1은 그들의 비자 종류를 가리킴)로 구성된다고 함.
- GenBank, BLAST, PubMed, Entrez, LocusLink, dbEST, dbSNP, RefSeq, Taxonomy Database 등을 실제 제작, 운영.
Information Resources Branch (IRB) 하드웨어, 소프트웨어 유지 (43명)
DNA chip(MicroArray)
DNA chip은 여러 genome project로부터 축적된 방대한 양의 유전정보를 이용하여 시료를 효율적으로 분석할 수 있는 가장 주목받고 있는 방법이다. 특히 이 기술은 유전자 발현, 변이나 다형성(SNP)등을 단시간에 대량으로 고속처리검색(HTS)함으로써 유전자의 기능을 밝히는 데 매우 유용한 것으로 판명되고 있다. 이는 DNA chip이 짧은 시간에 많은 양의 정보를 분석할 수 있으며 자동화가 용이하기 때문이다.
SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
같은 종의 다른 개체 간에 생긴 유전자 한 뉴클레오티드의 변화이다. 사람들의 DNA 염기 순서를 비교하며 많은 수의 염기서열을 읽으면 흔히 다른 염기가 같은 위치에서 발견되는데 이를 SNP라고 한다. 서론에서도 밝혔듯이 1,000개의 염기마다 1개꼴로 나타난다. 사람은 현재 총 염기쌍이 30만개로 추정되고 있으므로 1000만개 이상의 SNP를 가질 것으로 생각된다. 이러한 0.1%의 차이로 인해서 사람들마다 개인적 다양성이 보이게 되는 것이다. ( 피부, 키, 머리카락, 약물에 대한 반응 등이 각각 다르다.)
<생화학 실험 report>
프로테오믹스(Proteomics)

키워드

프로테오믹스,   Proteomics,   유전자,   단백질