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는 DNA가 많은 양의 단백질과 결합하고 있고 이러한 구조를 염색질이라고 한다. DNA에서부터 여러 과정을 거쳐 염색질 구조를 이룬다. 염색질은 세포분열주기에 따라서 구조가 크게 달라진다. 세포주기의 간기에 광학현미경으로 염색질을 관찰하면, 염색질이 핵전체에 퍼져 있는 형태로 보인다. 그러나 세포분열기에 관찰하면 염색체를 볼 수가 있는데, 특히 중기에서는 염색체가 가장 응축하고 진하게 나타나 염색체간에 쉽게 구별된다. 간기에 나타나는 염색질은 세포분열기 염색체만큼은 아니지만 이 염색질 또한 정교하게 정돈되어 있는 구조를 가지고 있다. 비록 간기일지라도 염색체의 동원체, 말단 부위 그리고 이외에도 염색체의 어떤 부위는 중기 염색체에서 볼 수 있는 것과 같이 이질 염색질이라는 매우 응축된 구조를 보여준다.
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