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먼저 c-myc이란?
세포 성장을 촉진하는 유전자를‘암유전자(oncogene)’
사람의 암에서 실제로 이상이 나타나는 빈도가 높은 유전자는 몇 개뿐
c-myc은 전사 과정에서
성장을 자극하는 유전자
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NCBI란?
▣서열 유사성검색 tool
1) FASTA
2) BLAST
① BLASTp
② BLASTn
③ BLASTx
④ tBLASTn
⑤ tBLASTx
3)BLAST의 장점
4) FASTA와 BLAST 의 비교
▣주요 용어 설명
▣NCBI-BLAST home page의 주요 구성
▣NCBI-BLAST 검색방법
1.NCBI site에 접속
2.조회할 서열
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NCBI란?
▣서열 유사성검색 tool
1) FASTA
2) BLAST
① BLASTp
② BLASTn
③ BLASTx
④ tBLASTn
⑤ tBLASTx
3)BLAST의 장점
4) FASTA와 BLAST 의 비교
▣주요 용어 설명
▣NCBI-BLAST home page의 주요 구성
▣NCBI-BLAST 검색방법
1.NCBI site에 접속
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UCSC browser
-기능
-장점
-유래
-사용방법
-tract의 종류와 각각의 기능, 사용법
-gene 검색법
-zoom in/out 방법
-configuration 방법
-gene highlighting 방법
4)ENCODE, GTEx
-ENCODE project
-ENCODE tract
-GTEx project
-GTEx tract
5)RB1이란
6) ① GENCODE v32 Track
② GTE
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p53)
Ⅱ. Method
1.gene sequence 검색 엔진, 검색 방법
2. sequence alignment 방법
3. protein modeling 방법
-UniProtKB
-SWISS-MODEL
III. Result
1) NCBI
2) sequence alignment
3) protein alignment
IV. Discussion
1) TP53 gene
2) sequence alignment와 phylogenentic tree
3) protein modelin
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