고대(세종) 생명정보공학과 효소화학 summary
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목차

● 효소

● Enzyme Species

● Classification

● 효소 촉매에 의한 화학반응 속도 증가 machnisms.

● 아미노산을 기본 building block으로 한 효소

● Mg+-APT complex

● NAD, NADH

본문내용

α carbonyl carbon이
Pyruvate dehydrogenase complex - TPP, Lipoic acid, CoA, FAD, NAD+ (5개)
우선 decarboxylation(탈탄산반응) : Pyruvate에 α-carbonyl carbon을 stabilize 시키면서 hydroxyl ethyl carbanion을 형성. TPP가 electron을 accepting을 해줌으로써 carbanion ion이 stabilize 되어있는 상태.
carbanion group(acyl group)을 lipoamide(lipoic acid)가 carrying해주고, 그 carrying한 acyl group을 acetyl coenzyme으로 replacing, transfer해 버림.
acetyl coenzyme(acetyl Co A)이 나오면 lipoamide는 disulfide bond가 끊어 졌기 때문에 reduction이 되어가지고 다시 산화시킴.
그 산화 시키는 과정을 coupling 해가지고 환원을 다른 물질을 시켜주는데 이것이 우리 생체반응. FAD가 환원이 됨.
FAD에 hydrogenation되는 것을 NAD로 다시 이관해주는 이러한 과정.
isocitrate dehydrogenase에 탈탄산반응은 pyruvate라든가 α-keto glutarate에서 탈탄산하는 거하고 틀림, 알아놓도록.
ex) 효소명 잘 알아둘 것.
ex) 우리 사람에게는 pyruvate decarboxylase가 존재 하는데 이런 decarboxylase는 예를 들어서 lactate를 어떻게 한다? lactate는 pyruvate로 바뀌며, 변환되는 과정에서 NADH를 생산해낸다.
non-oxidative decarboxylation
: Pyruvate decarboxylase, acetolactate synthetase, glyoxalate carboligase.
ex) Pyruvate를 dehydrogenase 시키면 뭐가 나와? Acetyl Co A. 이건 α-keto acids의 non-oxidative decarboxylation. 혐기적인 환경에서 이루어지는 것이므로 효모에서 발생. 그러니까 효모는 술(alcohol)을 만들게 되는 것임. 그럼 몸이 술로 차든가 아니 면은 초산으로 차게 됨. 초산(acetaldehyde)은 carboxyl group이 떨어져 나가면 이게 되거든 효모는 이걸 가지고서 바로 alcohol을 만드는 반면에 사람은, 요게 딱 있으면 alcohol은 못 만들고, 대신 사람은 젖산을 만듦. pyruvate가, pyruvate dehydrogenase에 의해 carboxyl group 떨어져 나가고, 초산이 생긴다.
ex) 다음 중 nucleophilic attack가 ATP에 γ phosphorus 원자에서 야기됨으로써 발생되는 대사산물은 뭐냐?? 대사산물들이 있는데 α attack를 했느냐? β attack를 했느냐? γ attack를 했느냐에 따라서 산물이 틀리게 나와~
α attack : L-alanyl-AMP + pyrophosphate
β attack : 5-phosphoribose-1-pyrophoshate + AMP
γ attack : glucose-6-phosphate +ADP
ex) 효소의 정상 반응 상태에서 NADH가 생성되는 경우 어느 거냐?
: isocitrate → α-ketoglutarate,
α-ketoglutarate →succinyl CoA,
malate →oxaloacetate,
glyceraldehyde 3-phosphate → 1,3-Disphosphoglycerate,
L-Lactate+NAD+Pyruvate+NADH,
maleate dehydrogenase로 fumarate → maleate
ex) 효모의 혐기 발효 할 때, 인체의 혐기 발효 할 때, 고농도의 암모니아 상태에 세포내 glutamic dehydrogenase, oxaloacetate의 농도가 낮은 상태에서의 maleate dehydroganase, 효소의 정상 반응 상태에서 NADH가 생성되는 경우 어느 거냐? oxaloacetate의 농도가 낮은 상태에서의 maleate dehydroganase
ex) 다음 효소 중에서 비가역반응을 촉매 하는 효소는 어느 것이냐? penicillin(ser residue of glycoprotein transpeptidase), Omeprazole-sulfenamide.
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  • 등록일2009.12.02
  • 저작시기2009.5
  • 파일형식한글(hwp)
  • 자료번호#564332
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