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1. Subject
MS-based methods for protein identification.
2. Purpose
질량분석기를 이용하여 분석하고자하는 단백질을 결정한다.
3. Material & Reagent
3.1 In-gel digestion (step1)
단백질(전기영동으로 나눈 아크릴아마이드 젤을 썻음)
• 파이펫
• Destai
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같기 때문에 큰 영향은 없었을 것으로 보이지만 elution한 환경이라던가 실험 환경이 차이가 났기 때문에 어느정도의 오차는 발생했을 것으로 생각된다.
10. 참고문헌
-생화학실험(1) 실험교본 chapter 12
- 생화학실험 ppt. Mass spectrometry
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Profound를 통한 results
6. 참고문헌
1) 생화학실험(1) 실험교본, 교육부의생명특성화사업단.
2) Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer. 2007, Biochemistry, sixth ed.
3) http://bric.postech.ac.kr/
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아미노산 서열 결정방법
1) Polypeptide의 부분분해
2) N-말단 결정법
3) C-말단 결정법
4) Tandem mass spectrometry
7. 분자량 측정방법
1) DNA분자의 분자량 측정
2) 단백질의 분자량 측정
8. 생화학적 특성
9. 결론
10. 참고문헌과 싸이트
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mass와 in silico에서 trypsin으로 처리한 peptide의 mass가 실제 같은 단백질이더라도, 반드시 일치하지 않을 수 있다. 첫 번째로, ACN gradient를 이용하여 대강의 seperation을 하긴 하였지만, 일부 peptide들은 엉키어서, mass가 매우 커졌을 수 있다. 이 경우,
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