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BLAST
① BLASTp
② BLASTn
③ BLASTx
④ tBLASTn
⑤ tBLASTx
3)BLAST의 장점
4) FASTA와 BLAST 의 비교
▣주요 용어 설명
▣NCBI-BLAST home page의 주요 구성
▣NCBI-BLAST 검색방법
1.NCBI site에 접속
2.조회할 서열을 준비한다.
3.검색에 사용할 BLAST program의
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BLAST
① BLASTp
② BLASTn
③ BLASTx
④ tBLASTn
⑤ tBLASTx
3)BLAST의 장점
4) FASTA와 BLAST 의 비교
▣주요 용어 설명
▣NCBI-BLAST home page의 주요 구성
▣NCBI-BLAST 검색방법
1.NCBI site에 접속
2.조회할 서열을 준비한다.
3.검색에 사용할 BLAST program의
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제가 직접 작성한 것이니 안심하셔도 됩니다.
lide 1) 저희 1조에서는 서열검색을 할 수 있는 도구중 하나인 BLAST에 대해서 조사 하였습니다
slide 2) blast란 basic local alignment search tool 의 약자로써
slide 3) ncbi에서 제공하는
쉽고 빠른 서열
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Bioinformatics의 정의와 목적
2) NCBI를 통해 사용할 수 있는 데이터베이스
-Pubmed
-GenBank
-dbSNP(Database of Short Genetic Variations)
3) Alternative Splicing
4) BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)
-DNA sequence의 conservation
-sequence alignment
-BLAST(Basic Local Alignment Se
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Bioinformatics Computer Skills, 한빛미디어, 2001
David W.Mount, Bioinformatics-Sequence and Genome Analysis, Cold Spring Harbor Lavoratory Press
※ 참고 사이트
http://old.medric.or.kr/educateNews/#
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=2
※ sample sequenc
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