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유전자의 산물의 이상이있는 경우 그 원인의 일차적인 규명에 mRNA의 분석이 필요하다.mRNA는 유핵세포의 전체 RNA 중 약 5 % 를 차지하며, 나머지 RNA는 라이보좀 RNA 와 운반 RNA(tRNA) 이다. mRNA 는 구조 유전자로 부터 전사되며, 그 길이는 수 백개의 염기 부터 수 천개의 염기 까지 매우 다양하다. 이것은 모두 세포속에 있는 단백질이나 폴리펩타이드를 만들기 위한 정보를 가지고 있다. 어떤 조직이나 세포에서 mRNA를 추출할 때 가장 중요한 것은 세포가 파괴될 때 나오는 RNA 분해효소 (RNAse)를 불활성화 시키는 것이다.이 효소는 RNA를 매우 신속히 파괴 시키기 때문이다. RNA 분해효소를 제거하기 위하여 모든 초자기구를 가열 처리하거나, RNA 분해효소를 억제하는 특이한 화학 억제제를 사용하여야 하며,후자의 방법이 널리 사용된다. mRNA의 추출은 먼저 RNA 분해효소 억제제인 guanidinium isothiocyanate 를 사용하여 세포를 파괴 시키고, 기계적으로 균질화 시키는 것이다.
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