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흔히 두 검체를 (i.e., 연구검체와 대조검체) 각각 다른 색으로 염색하여 경쟁적 결합(competitive binding)을 일으키는 이중염색 기법(Two-dye technique)을 많이 사용한다. 연구검체에는 적색 형광물질을 부착하고 대조검체에는 녹색 형광물질을 부착하여 두 형광물질의 발색강도의 적/녹 비율에 따라 mRNA의 발현량을 정량화한다. 발색강도는 이미지로 촬영된 후 이미지 분석기에 의해 수치 값으로 변환된다.
유전자칩 패러다임의 성공에 힘입은 바이오칩 신기술의 발전은 매우 급속히 이루어지고 있다. 단백칩과 미세거울을 이용한 올리고칩 뿐 아니라, 최근에는 이중나선 DNA칩으로 DNA-단백질 상호작용을 측정하는 기술이나, 세포칩, 조직칩 등 수많은 신기술이 하루가 다르게 출현하고 있다.
유전자칩 패러다임의 성공에 힘입은 바이오칩 신기술의 발전은 매우 급속히 이루어지고 있다. 단백칩과 미세거울을 이용한 올리고칩 뿐 아니라, 최근에는 이중나선 DNA칩으로 DNA-단백질 상호작용을 측정하는 기술이나, 세포칩, 조직칩 등 수많은 신기술이 하루가 다르게 출현하고 있다.
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