소 간 원심분획법 핵 미토콘드리아

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에 의해 결정된다. 일반적으로 세포균질화 용액은 먼저 낮은 속도로 원심분리하여 파쇄되지 않은 세포와 핵을 침전시킨다. 상등액(supernatant; 침전물을 제외하고 남은 용액)을 더 높은 속도로 원심분리 하면 미토콘드리아,염록체, 리소좀, 퍼옥시좀이 침전된다. 상등액을 보다 더 높은 속도로 원심분리 하면 이번에는 세포막과 소포체가 침전된다. 여기에서 얻어진 상등액을 더 높은 속도로 원심분리 하면 리보솜이 침전되며 상등액에는 세포질의 수용성부분(물, 염류, 유기분자, 고분자)이 남게 된다.
이렇게 분별원심분리를 통해 얻은 분획은 세포소기관들이 아직 순수하게 분리된 상태가 아니다. 더 높은 순도를 얻기 위해서는 밀도구배 원심분리(density-gradient centrifugation) 방법을 사용한다.

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