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를 인식하려면 염기가 몇 개 옆에 더 붙어있어야 된다.
또한, Open reading frame (ORF)은 주어진 reading frame에서 stop codon을 가지지 않는 DNA sequence로서 실제로 mRNA에서 단백질이 발현되는 부분이다. primer는 개시점과 종결점에 각각 특이적으로 결합시
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primer design을 다시함.
PCR 효율이 너무 낮다. (<90%)
Primer design 문제
Primer design sofeware를 이용하여 다시 디자인 한다.
a 최소한 2 primer pairs 준비하여 적당한 primer 이용
Annealing step이
너무 짧다
최대 30초까지 3초 단위로 늘려본다
Template의 오염
Templ
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design을 하시오. 단 CD는 PCR 방법으로 증폭하기로 하고 primer design으로부터 시작하시오. Double restriction enzyme digestion을 하되, 이 방법이 사용 불가능할 경우는 single digestion 방법을 사용하시오. enzyme 선택의 이유도 제시하시오.
4. Transformation 후,
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Primer를 Design할 수 있다. 이것은 다른 생물체에서 동일한 유전자의 분리를 위해 사용될 수 있다.
또한 유전자 돌연변이와 관련된 병의 여부를 판단하는데도 사용될 수 있는데, 즉, 유전병을 일으키는 유전자 돌연변이가 존재하는지 조사하는
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PCR 생산물의 cloning
* 배열순서
* 배열 데이터의 분석과 계통발생학 트리의 구성
* 배열 기준은 계통발생학 분석에서 사용한다.
* 다양한 PCR 시험
* 뉴클레오타이드 배열 첨부 번호
* Primer design과 Multiplex PCR assay.
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