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DNA와 linear DNA
대부분의 plasmid는 세포내에서 supercoiled circular DNA로 존재하며 이러한 supercoiling은 plasmid replication 과정 중에 topoisomerase에 의해 수행되어진다. plasmid DNA 가닥에 손상된 곳이 없을 때 covalently closed-circular(CCC) DNA를 형성하며 반대로 두
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DNA를 분석하려고 한다. DNA가 circular covalently closed(Supercoil)형태, Open circular형태, Linear형태로 되어있을 때 예상되는 전기영동 거리를 설명하라.
: DNA 형태(구조)에 따라 이동속도가 다르다. 일반적으로 supercoiled DNA가 가장 빨리, 그다음 linear DNA, op
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DNA 이중가닥이 변성되면서 부피가 커지면서 DNA가 많은 양의 EtBr과 결합하게 되어 더 잘 관찰 할 수 있게 된다.
같은 DNA이지만 이동속도에 차이가 생긴 이유
- Supercoiled(closed circular) DNA와 open circular DNA
세포(대장균)로부터 분리한 plasmid DNA 를 전
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DNA 분자의 크기가 클수록 느리게 이동한다.
2) Agarose의 농도가 높을수록 느리게 이동한다.
3) DNA 형태(구조)에 따라 이동속도가 다르다. 일반적으로 supercoiled DNA가 가장 빨리, 그 다음 linear DNA, open circular DNA의 순으로 빠르게 이동한다.
4) 부하
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DNA와 plasmid DNA는 서로의 크기와 구조의 차이 때문에 분리가 가능했다. chromosomal DNA가 plasmid DNA보다 훨씬 크고, 형태도 chromosomal DNA는 linear DNA인 반면에 plasmid DNA는 closed circular DNA이다. 그러므로 이런 차이로 인해 chromosomal DNA는 여러 요인으로 인
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