Helicobacter pylori(stringent response)

목차

1. Abstract

2. Introduction

3. Results

(1) The H.pylori produces (p)ppGpp under nutrient deprivation condition.

(2) The importance of the stringent response in stationary-phase survival in H.pylori.

(3) The H.pylori ΔspoT mutant transforms to the coccoid transition prematurely.

(4) The stringent response is required for H.pylori survival in aerobic and acidic stress.

4. Conclusion

5. Reference

본문내용

시간 동안 배양하였다. 처음 2시간 동안에는 acidic condition은 노출된 모든 strain에게 큰 영향을 주지 않았다. 그러나 3시간 후에는 ΔspoT strain의 viability는 항상 WT와 spoT* strain의 viability보다 눈에 띄게 감소한 것을 볼 수 있었다 (Fig. 8B). 그리고 세 번의 비의존적 실험에서 spoT* strain은 적은 변화량을 나타냈지만, 3시간 지점에서 WT strain의 viability보다 눈에 띄게 증가하였다.
Fig. 8. The ΔspoT mutant has impaired survival in aerobic and acidic stress. (A) WT, ΔspoT, and spoT* H.pylori strains were incubated under ambient atmospheric conditions at 37℃ and shaken at 150 rpm. (B) WT, ΔspoT, and spoT* H.pylori strains were incubated by shaking in pH4 media with 0.5 mM urea, at 37℃. Representative assays of at least three trials are shown. Error bars indicate the standard deviations of replicate plating. The limits of detection of the assays were 10 CFU ㎖¹ in panel B.
Fig. 9. H.pylori produces (p)ppGpp upon pH downshift. H.pylori strain G27 was grown to early log phase in rich medium at neutral pH and then diluted 1:1 either in rich medium at neutral pH (final pH 7.0) or in rich medium at pH 3.0 (final pH 4.5) and labeled with ³²Pi. Nucleotides were resolved by TLC. (p)ppGpp corresponding to guanosine penta- and tetraphosphate in the pH 4.5 sample is indicated by the arrow. This spot was quantified by densitometer analysis and found to be ~4.5-fold higher than in the pH 7.0 control.
4. Conclusion
Helicobacter pylori는 가장 널리 알려진 human pathogen 중의 하나이다. 그럼에도 H.pylori가 인간에 infection, transmission하는 동안의 생존을 위한 전략은 잘 알려지지 않았다. 아주 작은 H.pylori의 genome은 몇 개 되지 않는 transcription factor를 encode한다. 하지만 이 작은 bacteria가 어떻게 인간의 위장과 같은 변화가 심한 환경에서 적응해 가는지는 의문이었다. 그래서 지금까지의 실험으로써 (p)ppGpp를 합성하는 stringent response regulator인 SpoT가 다양한 불안정한 환경 조건에서 H.pylori의 생존에 영향을 미칠 수 있는지 알아보았다.
H.pylori는 nutrient deprivation condition에서 (p)ppGpp를 생산한다. rich medium에서보다 눈에 띄게 많은 양을 minimal medium에서 생산한 것을 실험 결과로써 알 수 있었다. 이것은 극한 상황에서 stringent response를 사용함을 나타내는 것이다. 그리고 nutrient downshift에서의 (p)ppGpp 생산에 spoT gene이 관여한다는 것도 알 수 있었다. 이 spoT gene의 결실은 stationary-phase에서의 H.pylori의 survival과 coccoid 형성에도 큰 영향을 미친다. spoT가 H.pylori의 stringent response를 위해 (p)ppGpp 생산에 큰 역할을 함을 atmospheric exposure와 acidic stress에서의 H.pylori viability를 통하여 알 수 있었다.
5. References
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◎ Jain, V., M. Kumar, and D. Chatterji. 2006. ppGpp: stringent response and survival. J. Bacteriol. p. 1-10.

키워드

helicobacter pylori,   stringent response,   졸업논문,   생명공학