[생물정보학] NCBI BLAST 사용 법 -ppt

소개글

[생물정보학] NCBI BLAST 사용 법 -ppt에 대한 보고서 자료입니다.

목차

차례:
▣NCBI란?

▣서열 유사성검색 tool
1) FASTA
2) BLAST
① BLASTp
② BLASTn
③ BLASTx
④ tBLASTn
⑤ tBLASTx

3)BLAST의 장점
4) FASTA와 BLAST 의 비교

▣주요 용어 설명

▣NCBI-BLAST home page의 주요 구성

▣NCBI-BLAST 검색방법
1.NCBI site에 접속
2.조회할 서열을 준비한다.
3.검색에 사용할 BLAST program의 선택
4.Query 입력
5.옵션 조정
6.결과창의 분석

▣실전!검색 방법

[끝]

본문내용

5.옵션 조정
커다란 빈칸에 서열을 입력한뒤 이제 옵션을 조정해야 하는데, 나열하자면 우선
1.상단박스인 [Enter Query Sequence]의 옵션들
○1“Query subrange”
:이는 frome 과 to 로써 검색 suquence의 길이에 제한을 줄수있다. 출발점을 frome에 입력하고 마지막점을 to에 입력하면 된다.
○2”Or, upload file”
:이는 빈칸에 하나하나 직접 서열입력이 아닌 한반에 파일입력이라는 방법으로써 사용할수 있는 항목으로써, 예를들어 메모장의 TXT파일도 가능하다.
○3 “Job Title”
:이는 지금하는 서열검색에 대한 제목(title)을 다는것으로써, 이 옵션을 통해 타이틀을 닮으로해서후에 메뉴인 Recent Results와 Saved Strategies에서 다시 정보를 살펴볼 때 좀더 편리하게 관람/분류가 가능할 수 있다.
○4 체크박스 “Align two or more sequences”
:이 체크박스는 두개나 혹은 그이상의 서열을 정렬하고자 할 때 체크한다. 체크하게되면 위에서봤던 Query를 입력할 수 있는 큰 blank가 실제로 하나 더 추가되는 것을 볼수 있다.

키워드

NCBI,   BLAST,   Bioinformatics,   생물정보학,   미생물학,   단백질공학,   생명정보학,   생물공학